參考答案：

　　1.不妥之處：建設(shè)單位接受并簽發(fā)甲施工單位報(bào)送的開工報(bào)審表; 理由：開工報(bào)審表應(yīng)報(bào)項(xiàng)目監(jiān)理機(jī)構(gòu)，由總監(jiān)理工程師簽發(fā)，并報(bào)建設(shè)單位。

　　2.事件2中，總監(jiān)理工程師和建設(shè)單位的做法有以下兩處不妥：

　　(1)項(xiàng)目監(jiān)理機(jī)構(gòu)收到施工單位提交的工程變更申請(qǐng)后，總監(jiān)理工程師直接與設(shè)計(jì)單位聯(lián)系不妥。

　　(2)總監(jiān)理工程師向建設(shè)單位報(bào)告施工單位申請(qǐng)工程變更事宜后，隨即要求修改施工圖并簽署變更文件不妥。

　　項(xiàng)目監(jiān)理機(jī)構(gòu)收到甲施工單位提交的工程變更申請(qǐng)后，正確的處理程序如下：

　�、倏偙O(jiān)理工程師報(bào)建設(shè)單位;

　�、诮ㄔO(shè)單位聯(lián)系設(shè)計(jì)單位;

　�、墼O(shè)計(jì)單位修改施工圖并簽署設(shè)計(jì)變更文件;

　�、芙ㄔO(shè)單位收到設(shè)計(jì)變更文件后轉(zhuǎn)交項(xiàng)目監(jiān)理機(jī)構(gòu);

　　⑤總監(jiān)理工程師向甲施工單位發(fā)出工程變更單。

　　3.不妥之處：項(xiàng)目監(jiān)理機(jī)構(gòu)受理乙施工單位的支付申請(qǐng)，并簽發(fā)付款憑證;

　　理由：乙施工單位和建設(shè)單位沒有合同關(guān)系。

　　4.(1)不妥之處一：未按時(shí)限備案;

　　理由：應(yīng)在驗(yàn)收合格后15日內(nèi)備案。

　　(2)不妥之處二：要求乙施工單位將一面承重墻改為玻璃窗結(jié)構(gòu);

　　理由：修改墻體結(jié)構(gòu)應(yīng)經(jīng)原設(shè)計(jì)單位或具有相應(yīng)資質(zhì)等級(jí)的設(shè)計(jì)單位提出設(shè)計(jì)方案。

　　(3)不妥之處三：要求甲施工單位無償修理。

　　理由：不屬于保修范圍，由修改承重墻造成的已驗(yàn)收合格管道破壞，由乙施工單位修理。

　　5.(1)對(duì)建設(shè)單位應(yīng)予處罰;

　　理由：未按時(shí)備案，擅自修改墻體結(jié)構(gòu)。

　　(2)對(duì)監(jiān)理單位不應(yīng)處罰;

　　理由：監(jiān)理單位無過錯(cuò)，工程已驗(yàn)收合格。

　　(3)對(duì)甲施工單位不應(yīng)處罰;

　　理由：甲施工單位無過錯(cuò)，工程已驗(yàn)收完成，分包合同已解除。

　　(4)對(duì)乙施工單位應(yīng)予處罰;

　　理由：對(duì)涉及承重墻的改造，無設(shè)計(jì)圖紙施工。