石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院是首批國家級(jí)住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地。2009年成為國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)試點(diǎn)基地;2013年9月通過自治區(qū)規(guī)范化培訓(xùn)基地評(píng)審，首批通過了12個(gè)專業(yè)基地：內(nèi)科、兒科、急診科、皮膚科、精神科、全科、外科、婦產(chǎn)科、臨床病理科、檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)科、放射科、口腔全科;2014年8月通過兵團(tuán)上報(bào)并認(rèn)定為兵團(tuán)唯一一家國家級(jí)住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地;2015年進(jìn)行新增了16個(gè)專業(yè)基地的申報(bào)并通過省級(jí)認(rèn)定，分別為：神內(nèi)科、康復(fù)醫(yī)學(xué)科、神經(jīng)外科、心胸外科、泌尿外科、整形外科、骨科、眼科、耳鼻咽喉科、麻醉科、超聲科、核醫(yī)學(xué)科、放射腫瘤科、口腔內(nèi)科、口腔頜面外科和口腔修復(fù)科，現(xiàn)共有28個(gè)專業(yè)基地。