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      質(zhì)量工程師綜合輔導(dǎo):X射線(xiàn)單晶體衍射儀

      考試網(wǎng)(mcjgcyingcheng.com)  2008年5月3日  
        一。引言
        
      X射線(xiàn)單晶體衍射儀的英文名稱(chēng)是X-ray single crystal diffractometer,簡(jiǎn)寫(xiě)為XRD.本儀器分析的對(duì)象是一粒單晶體,如一粒砂糖或一粒鹽。在一粒單晶體中原子或原子團(tuán)均是周期排列的。將X射線(xiàn)(如Cu的Kα輻射)射到一粒單晶體上會(huì)發(fā)生衍射,由對(duì)衍射線(xiàn)的分析可以解析出原子在晶體中的排列規(guī)律,也即解出晶體的結(jié)構(gòu)[1].物質(zhì)或由其構(gòu)成的材料的性能是與晶體的結(jié)構(gòu)密切相關(guān)的,如金剛石和石墨都是由純的碳構(gòu)成的,由于它們的晶體結(jié)構(gòu)不同就有著截然不同的性質(zhì)。
        二。X射線(xiàn)單晶體衍射儀測(cè)定晶體結(jié)構(gòu)的原理和儀器構(gòu)造[2,3]
       。ㄒ唬┚w衍射的基本公式
        
      由于晶體中原子是周期排列的,其周期性可用點(diǎn)陣表示。而一個(gè)三維點(diǎn)陣可簡(jiǎn)單地用一個(gè)由八個(gè)相鄰點(diǎn)構(gòu)成的平行六面體(稱(chēng)晶胞)在三維方向重復(fù)得到。一個(gè)晶胞形狀由它的三個(gè)邊(a,b,c)及它們間的夾角(γ,α,β)所規(guī)定,這六個(gè)參數(shù)稱(chēng)點(diǎn)陣參數(shù)或晶胞參數(shù),見(jiàn)圖1.這樣一個(gè)三維點(diǎn)陣也可以看成是許多相同的平面點(diǎn)陣平行等距排列而成的,這樣一族平面點(diǎn)陣稱(chēng)為一個(gè)平面點(diǎn)陣族,常用符號(hào)HKL(HKL為整數(shù))來(lái)表示。一個(gè)三維空間點(diǎn)陣劃分為平面點(diǎn)陣族的方式是很多的,其平面點(diǎn)陣的構(gòu)造和面間距d可以是不同的,見(jiàn)圖1.晶體結(jié)構(gòu)的周期性就可以由這一組dHKL來(lái)表示。
        圖1  代表結(jié)晶體周期性的點(diǎn)陣一個(gè)小晶體衍射X射線(xiàn),其衍射方向是與晶體的周期性(d)有關(guān)的。一個(gè)衍射總可找到一個(gè)晶面族HKL,使它與入射線(xiàn)在此面族上符合反射關(guān)系,就以此面族的符號(hào)HKL作為此衍射之指數(shù)。其間關(guān)系用布拉格方程(式1)來(lái)表示。
               2dHKLsinθHKL=nλ                   (1)
        式中,θHKL為入射線(xiàn)或反射線(xiàn)與晶面族之間的夾角(見(jiàn)圖2),λ為入射X射線(xiàn)波長(zhǎng),n為反射級(jí)數(shù)!         
        圖2    布拉格反射示意圖衍射線(xiàn)的強(qiáng)度是與被重復(fù)排列的原子團(tuán)的結(jié)構(gòu),也即和原子在晶胞中的分布裝況(坐標(biāo))有關(guān),其間的關(guān)系由方程式(2)表示(2)
        式中, E稱(chēng)為累積能量,I0為入射線(xiàn)強(qiáng)度,e, m為電子的電荷與質(zhì)量,c為光速,λ為X射線(xiàn)波長(zhǎng),Vu為晶胞體積,稱(chēng)洛侖茲偏振(LP)因子,|F|為結(jié)構(gòu)振幅,e-2MT為溫度因子,A為吸收因子,V為小單晶體的體積,ω為樣品的轉(zhuǎn)速,其中結(jié)構(gòu)因子==|FHKL|eiαHKL        (3)
                       
        式中,fj, xj,yj,z 分別為第j個(gè)原子的原子散射因子及它在晶胞中的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)(以晶胞邊長(zhǎng)為1)。n
      為晶胞中的原子數(shù)。αHKL為HKL衍射的相角。從此式可知衍射線(xiàn)強(qiáng)度是與各原子在晶胞中的位置(即結(jié)構(gòu))有關(guān)的,故反過(guò)來(lái)可從衍射線(xiàn)強(qiáng)度的分析解出晶胞中各原子的位置,即晶體結(jié)構(gòu)。其方法是 (4)
        通過(guò)晶胞中的電子密度ρ(x,y,z)的計(jì)算。
        故若知各衍射的FHKL, 就可按(4)式計(jì)算晶胞的三維電子密度圖。原子所在處電子密度應(yīng)該很高,故依此可定出原子在晶胞中位置,得出晶體結(jié)構(gòu)。但是從衍射強(qiáng)度獲得的是結(jié)構(gòu)振幅|F|,|F|與F之間的關(guān)系見(jiàn)式(3)。如何求得各HKL衍射的相角αHKL就成為X射線(xiàn)單晶衍射解晶體結(jié)構(gòu)的關(guān)鍵。
        (二)對(duì)實(shí)驗(yàn)的要求和實(shí)驗(yàn)儀器
        1.對(duì)實(shí)驗(yàn)的基本要求:要按式(4)來(lái)求解晶體結(jié)構(gòu),就要有盡可能多的衍射的FHKL,而且其值要準(zhǔn)確, 這樣所得的ρ(x,y,z)分辯率就高,求得的結(jié)構(gòu)就準(zhǔn)確。一粒小晶體衍射的X射線(xiàn)是射向整個(gè)空間的。具有大的HKL,也即大θ或小d值的衍射的強(qiáng)度一般比較低,不易測(cè)得。如何在三維空間測(cè)得盡可能多的,盡可能準(zhǔn)確的衍射線(xiàn)強(qiáng)度成為對(duì)X射線(xiàn)單晶體衍射儀的基本要求。
        2.實(shí)驗(yàn)儀器若將一束單色X射線(xiàn)射到一粒靜止的單晶體上,入射線(xiàn)與晶粒內(nèi)的各晶面族都有一定的交角θ,其中只有很少數(shù)的晶面能符合布拉格公式而發(fā)生衍射。如何才能使各晶面族都發(fā)生衍射呢?最常用的方法就是轉(zhuǎn)動(dòng)晶體。轉(zhuǎn)動(dòng)中各晶面族時(shí)刻改變著與入射線(xiàn)的交角,會(huì)在某個(gè)時(shí)候符合布拉格方程而產(chǎn)生衍射。目前常用的收集單晶體衍射數(shù)據(jù)的方法,一為回?cái)[法,二為四圓衍射儀法。
        (1)回?cái)[法:
        回?cái)[法的裝置如圖3,樣品的轉(zhuǎn)軸垂直于入射單色X射線(xiàn),圍繞轉(zhuǎn)軸安裝園筒狀底片或在晶體后方,垂直于入射線(xiàn)安裝平板底片。若晶體的某一晶軸(如a或b, c)與轉(zhuǎn)軸平行,則在園筒狀底片上會(huì)出現(xiàn)平行直線(xiàn),平板底片則出現(xiàn)上下對(duì)稱(chēng)的雙曲線(xiàn)。若讓晶體在一個(gè)不大的角度范圍(如10)內(nèi)做擺動(dòng),則能產(chǎn)生的衍射數(shù)量不多,衍射點(diǎn)不會(huì)重疊。使擺動(dòng)范圍連續(xù)變動(dòng),一套完整的衍射數(shù)據(jù)需由一套(如幾十張)擺動(dòng)照片組成,其數(shù)量與晶體的對(duì)稱(chēng)性有關(guān)。
        圖3回?cái)[法裝置構(gòu)造示意圖。
        回?cái)[法是一種早就發(fā)明的衍射方法,它的記錄介質(zhì)過(guò)去用的是照相底片,很不方便,因此用得不多。二十世紀(jì)九十年代發(fā)展出一種稱(chēng)為影象板(image-plate IP)的記錄介質(zhì),由于其靈敏度高,記錄的強(qiáng)度準(zhǔn)確,且使用方便,實(shí)驗(yàn)時(shí)間短,獲得了推廣,應(yīng)用到回?cái)[法,使回?cái)[法獲得新生, 成為測(cè)定單晶體結(jié)構(gòu)的主要方法。以后又出現(xiàn)了新型探測(cè)器電荷偶合器件(charge-couple device CCD),其性能在一些方面更優(yōu)于IP,有成為主要探測(cè)器的趨勢(shì)。
       。ǎ玻   四圓衍射儀法
        儀器構(gòu)造示意于圖4.常用閃爍計(jì)數(shù)器作探測(cè)器。入射光和探測(cè)器在一個(gè)平面內(nèi)(稱(chēng)赤道平面), 晶體位于入射光與探測(cè)器的軸線(xiàn)的交點(diǎn),探測(cè)器可在此平面內(nèi)繞交點(diǎn)旋轉(zhuǎn),因此只有那些法線(xiàn)在此平面內(nèi)的晶面族才可能通過(guò)樣品和探測(cè)器的旋轉(zhuǎn)在適當(dāng)位置發(fā)生衍射并被記錄。如何讓那些法線(xiàn)不在赤道平面內(nèi)的面族也會(huì)發(fā)生衍射并能被記錄呢?辦法是讓晶體作三維旋轉(zhuǎn),有可能將那些不在赤道平面內(nèi)的晶面族法線(xiàn)轉(zhuǎn)到赤道平面內(nèi),讓其發(fā)生衍射,四圓衍射儀正是按此要求設(shè)計(jì)的。圖4(a),(b)為按上述原理設(shè)計(jì)的,構(gòu)造上略有不同的兩種四圓衍射儀。此法曾經(jīng)是二十世紀(jì)八,九十年代的主要實(shí)驗(yàn)方法。此衍射儀的特點(diǎn)是用閃爍計(jì)數(shù)器逐點(diǎn)記錄各衍射,因此比較費(fèi)時(shí),常常需要幾天甚至超過(guò)一個(gè)星期的時(shí)間。以后,他不能適應(yīng)生物大分子要求快速記錄衍射數(shù)據(jù)的要求,IP、 CCD的出現(xiàn),快捷的回?cái)[法就逐漸取代他成為測(cè)定生物大分子結(jié)構(gòu)的主要工具。四圓衍射儀法在小分子結(jié)構(gòu)的測(cè)定中還有一定應(yīng)用。
        圖4.四圓衍射儀的構(gòu)成示意圖 
        二。衍射數(shù)據(jù)的處理——晶體結(jié)構(gòu)的解析
       
       (一)一般步驟
        1.  選擇大小適度,晶質(zhì)良好的單晶體作試樣, 收集衍射數(shù)據(jù)。
        2.  指標(biāo)化衍射圖,求出晶胞常數(shù),依據(jù)全部衍射線(xiàn)的衍射指標(biāo),總結(jié)出消光規(guī)律,推斷晶體所屬的空間群。
        3.  將測(cè)得的衍射強(qiáng)度作吸收校正,LP校正等各種處理以得出結(jié)構(gòu)振幅|F|. 4.  相角和初結(jié)構(gòu)的推測(cè)。常用推測(cè)相角的方法有派特遜函數(shù)法及直接法。
        派特遜函數(shù)的定義為:(5)
        從派特遜圖上可以比較容易地得到晶體中所含重原子的位置坐標(biāo),可依此計(jì)算各衍射的相角αHKL,將此αHKL去與實(shí)驗(yàn)測(cè)得的結(jié)構(gòu)振幅|FHKL|結(jié)合生成FHKL,可據(jù)此計(jì)算電子密度圖,可以定出更多原子的原子位置及修正已有的原子位置。再利用這些數(shù)據(jù)重新計(jì)算αHKL、FHKL及ρ(x,y,z),如此反復(fù)疊代多次推出完整的晶體結(jié)構(gòu)。
        直接法是利用結(jié)構(gòu)振幅間的某些統(tǒng)計(jì)關(guān)系求出衍射相角的方法。在求出某些衍射的相角αHKL以后,把他們?nèi)ヅc實(shí)驗(yàn)測(cè)得的|FHKL|配合生成FHKL,進(jìn)而計(jì)算ρ(x,y,z),從中獲得部分原子的位置,從此修正和擴(kuò)充已有的相角,如派特遜那樣反復(fù)疊代以得出完整的結(jié)構(gòu)。
        5.結(jié)構(gòu)的精修。由派特遜函數(shù)或直接法推出的結(jié)構(gòu)是較粗糙和可能不完整的,故需要對(duì)此初始結(jié)構(gòu)進(jìn)行完善和精修。常用的完善結(jié)構(gòu)的方法稱(chēng)為差值電子密度圖,常用的精修結(jié)構(gòu)參數(shù)的方法是最小二乘方法,經(jīng)過(guò)多次反復(fù),最后可得精確的結(jié)構(gòu)。同時(shí)需計(jì)算各原子的各向同性或各向異性溫度因子及位置占有率等因子。  
        最終所得結(jié)果的優(yōu)劣常用吻合因子R來(lái)衡量式中,w為權(quán)重因子,下標(biāo)o,c表示實(shí)測(cè)值,計(jì)算值。
        6.  結(jié)構(gòu)的表達(dá):在獲得精確的原子位置以后,要把結(jié)構(gòu)完美的表達(dá)出來(lái),這包括鍵長(zhǎng)鍵角的計(jì)算,繪出分子結(jié)構(gòu)圖和晶胞圖,并從其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)探討某些可能的性能。
       。ǘ┥锎蠓肿咏Y(jié)構(gòu)的測(cè)定[4]
        
      生物大分子結(jié)構(gòu)的測(cè)定,從原理上講與小分子(無(wú)機(jī)物,有機(jī)物,配合物等)無(wú)異,但由于分子大也帶來(lái)一定的特殊性,需要有一些不同于小分子的方法。
        大分子的特點(diǎn)是分子量大,原子多,但原子序數(shù)小, 多數(shù)是C,H,O,N等輕元素,故散射能力低,不易收集到高角的衍射點(diǎn),這會(huì)使電子密度圖的分辨率降低。還因他晶胞大,所含原子數(shù)目多,需確定的結(jié)構(gòu)參數(shù)就多,這與分辨率低有矛盾。另外,大分子晶體在X射線(xiàn)的照射下易于損壞,如何縮短實(shí)驗(yàn)時(shí)間也成為一個(gè)重要問(wèn)題。
        大分子由于分子量大,要求使用較大體積的單晶體,如對(duì)于分子量為5000的蛋白質(zhì)分子,就要有大于0.3mm3的單晶體。但因其分子大,結(jié)晶就困難,而且很易結(jié)晶成孿晶,這不合用。得到合用的晶體是整個(gè)大分子結(jié)構(gòu)測(cè)定中關(guān)鍵的一步,常說(shuō)有了良好的晶體,結(jié)構(gòu)測(cè)定一半的問(wèn)題已解決了。
        一般用回?cái)[法收集衍射數(shù)據(jù),用IP或CCD作探測(cè)器,可以在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)完成數(shù)據(jù)收集工作。
        關(guān)于相角問(wèn)題,在解小分子結(jié)構(gòu)中目前最常使用的直接法還不能用于大分子,而派特遜法,由于大分子缺少重原子也無(wú)法使用。目前是用基于派特遜法的幾個(gè)方法來(lái)解決相角問(wèn)題的。
        (1)分子取代法:有時(shí), 幾個(gè)不同的生物大分子是由相同的結(jié)構(gòu)單位以不同方式連接而成的; 同一種生物大分子如在不同的條件中結(jié)晶,有可能得到不同的結(jié)晶,是為多結(jié)晶現(xiàn)象; 還有些生物分子,他們是由共同的分子祖先進(jìn)化而得, 因此其中有相當(dāng)部分是相同的。 對(duì)于這些類(lèi)的生物分子,他們的派特遜圖常有很大的相似性。 因此,在求解某生物大分子結(jié)構(gòu)時(shí),如能找到與他有類(lèi)似的結(jié)構(gòu),且結(jié)構(gòu)已測(cè)定的生物大分子結(jié)構(gòu)時(shí),則可按最大重疊原理找出待測(cè)物和已知物的派特遜圖之間的關(guān)系, 從而得出未知物衍射的位相,進(jìn)而解出結(jié)構(gòu)。若已知物和待測(cè)物是同晶化合物,則可利用差值電子密度圖來(lái)解出結(jié)構(gòu),更為簡(jiǎn)單。
        若在已知結(jié)構(gòu)的大分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中找不到與待測(cè)物有類(lèi)似結(jié)構(gòu)的分子結(jié)構(gòu)時(shí),就不能使用此法,要使用以后的方法。
       。2)重原子同晶置換法:這種方法是設(shè)法把對(duì)X射線(xiàn)散射能力大的重金屬原子,如Hg,Pb,Se等引入生物分子中,作為標(biāo)識(shí)原子。這種置換入重原子的大分子應(yīng)與無(wú)重原子時(shí)的原晶體有相同的晶胞參數(shù)和空間群,且絕大多數(shù)原子的位置相同,故稱(chēng)同晶置換。從這些含重原子晶體的衍射數(shù)據(jù),利用基于派特遜法的方法可解出重原子的位置,據(jù)此算出其結(jié)構(gòu)因子和相角,進(jìn)而利用相角關(guān)系計(jì)算出沒(méi)有重原子的原晶體的相角,解出結(jié)構(gòu)。
        經(jīng)常使用不只一種重原子進(jìn)行置換,以得幾種同晶置換衍生物, 稱(chēng)多對(duì)同晶置換法。同晶置換衍生物越多, 可正確定出的相角也越多。
       。3)反常散射法晶體衍射中有一條弗里德耳定律, 就是說(shuō)不論晶體中是否存在對(duì)稱(chēng)中心,在晶體衍射中總存在著對(duì)稱(chēng)中心,也即有FHKL=FHKL.但是當(dāng)使用的X射線(xiàn)波長(zhǎng)與待測(cè)樣品中某一元素的吸收邊靠近時(shí),就不遵從上述定律,也即FHKL≠FHKL.這是由電子的反常散射造成的, 利用這一現(xiàn)象可以解決待測(cè)物的相角問(wèn)題。 一般, 這一方法常與重原子同晶置換法結(jié)合使用。
        在收得同晶置換物的衍射數(shù)據(jù)后, 改變?nèi)肷渚(xiàn)波長(zhǎng)至靠近重原子的吸收邊處,再次收集數(shù)據(jù),這套數(shù)據(jù)是存在反常散射的,可利用這兩套數(shù)據(jù)來(lái)求位相。有如多同晶置換法,如采用幾個(gè)不同波長(zhǎng)的X射線(xiàn),對(duì)所含不同元素收集幾套反常散射數(shù)據(jù),則可得更正確、更完整的相位信息,是為多波長(zhǎng)反常衍射法(MAD),是目前解分子生物大分子的重要方法。實(shí)驗(yàn)室X射線(xiàn)光源不易使用這一方法, 因要改變X射線(xiàn)波長(zhǎng)是很困難的,而對(duì)于同步X射線(xiàn)光源, 改變波長(zhǎng)是相當(dāng)方便的, 因此常被使用!
        四。應(yīng)用
        
      晶體結(jié)構(gòu)的測(cè)定對(duì)學(xué)科的發(fā)展、物體性能的解釋、新產(chǎn)品的生產(chǎn)和研究等方面都有很大的作用,其應(yīng)用面很寬,不能盡述,略談幾點(diǎn)如下:
       。ㄒ唬。晶體結(jié)構(gòu)的成功測(cè)定,在晶體學(xué)學(xué)科的發(fā)展上起了決定的作用。因?yàn)樗麑⒕w具有周期性結(jié)構(gòu)這一推測(cè)得到了證實(shí),使晶體的許多特性得到了解釋?zhuān)喝缇w能自發(fā)長(zhǎng)成多面體外形(自范性),如立方體的食鹽、六角形的水晶等,又如晶體各種物理性質(zhì)(光性,導(dǎo)熱性等)的各向異性和對(duì)稱(chēng)性等等。晶體學(xué)的發(fā)展有了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
       。ǘ。礦物學(xué)中曾有不少礦物的元素構(gòu)成很接近,但他們的性質(zhì)相差很遠(yuǎn)(如石墨和金剛石都是碳,還如一些硅酸鹽),而有的礦物其物理或化學(xué)性質(zhì)相近,但其元素組成又很不相同(如云母類(lèi)礦物等),使人困惑。晶體結(jié)構(gòu)的測(cè)定使性能的異同從結(jié)構(gòu)上得到了合理的解釋。如石墨因是層狀結(jié)構(gòu),層間結(jié)合力差,故較軟,而金剛石為共價(jià)鍵形成的骨架結(jié)構(gòu),故結(jié)合力強(qiáng),無(wú)薄弱環(huán)節(jié), 成為最硬的材料。
       。ㄈH祟(lèi)和疾病作斗爭(zhēng),總離不開(kāi)藥物。原始的藥物是天然產(chǎn)物,動(dòng)植物或礦物。以后隨著科學(xué)的發(fā)展,開(kāi)展了從天然產(chǎn)物中提取有效成分的方法,而有效成分晶體結(jié)構(gòu)的測(cè)定進(jìn)一步將從天然產(chǎn)物中提取的方法改變?yōu)槿斯ず铣,使有可能大量制造,提高了產(chǎn)量、降低了成本、造福于人類(lèi)。這種基于結(jié)構(gòu),設(shè)計(jì)出合成路線(xiàn),工業(yè)制造的方法在染料,香料等許多工業(yè)部門(mén)都是廣泛使用的。
       。ㄋ模┙,基于病毒結(jié)構(gòu)、人體內(nèi)各種大分子結(jié)構(gòu)的測(cè)定及人體感染疾病途徑的了解,搞清了某些疾病感染及發(fā)展的結(jié)構(gòu)匹配需要。人類(lèi)已經(jīng)根據(jù)這些結(jié)構(gòu)知識(shí)設(shè)計(jì)結(jié)構(gòu)上匹配的、合適的藥物,來(lái)事先保護(hù)病毒和人體的結(jié)合點(diǎn),或阻斷病毒的自身繁衍,從而避免感染或控制其繁衍,而不使疾病發(fā)展, 這就是所謂的基于結(jié)構(gòu)的、合理的藥物設(shè)計(jì)[6].圖5中為艾滋病毒復(fù)制過(guò)程中不可缺的蛋白酶及人類(lèi)設(shè)計(jì)的對(duì)稱(chēng)性抑制劑A-74704(方框內(nèi))之間的氫鍵結(jié)合模式。由于抑制劑的結(jié)合阻斷了病毒的結(jié)合,使其無(wú)法復(fù)制。改變了過(guò)去神農(nóng)嘗百草型的經(jīng)驗(yàn)尋找藥物的方法。
        圖5 抑制劑與蛋白酶的氫鍵結(jié)合
        五。 可能的發(fā)展方向:
       。ㄒ唬⿺(shù)據(jù)的積累從前述的應(yīng)用已經(jīng)看出,晶體結(jié)構(gòu)的測(cè)定及結(jié)構(gòu)與性能關(guān)系的研究, 是今后走上人類(lèi)按需設(shè)計(jì)新材料的基礎(chǔ)。今日雖已測(cè)了許多晶體的結(jié)構(gòu),但還有許多未能測(cè)定,而且還不斷有新化合物,新晶體出現(xiàn), 因此不斷的測(cè)定他們的結(jié)構(gòu),加以總結(jié)分析是十分必要的。當(dāng)今已有多個(gè)晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),如:
       。1)劍橋結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(CSD)。包括各種有機(jī),有機(jī)金屬化合物及配合物的晶體學(xué)數(shù)據(jù)。
       。2)無(wú)機(jī)晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(ICSD)。
        (3)金屬結(jié)晶學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(CRXSTMET)。
       。4)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)。
       。5)晶體學(xué)數(shù)據(jù)(CD)。
       。6)粉末衍射卡片(PDF)。
       。7)有序無(wú)序結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(OD)等。
        (二)各種生物大分子結(jié)構(gòu)的測(cè)定2001年2月12日,人類(lèi)基因組框架圖發(fā)表。接下來(lái)的任務(wù)是要把各基因的結(jié)構(gòu)和功能搞清楚,有大量的基因結(jié)構(gòu)需要測(cè)定。世界上已經(jīng)成立了結(jié)構(gòu)基因組的國(guó)際合作組織,分配人類(lèi)基因結(jié)構(gòu)的測(cè)定任務(wù)。除了人類(lèi)基因以外,還有水稻基因組,各種病毒等范圍更廣的生物大分子結(jié)構(gòu)需測(cè)定。生物大分子的數(shù)量將會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)各種無(wú)機(jī)物,有機(jī)物分子的總量。生物大分子結(jié)構(gòu)測(cè)定將是今后晶體結(jié)構(gòu)測(cè)定的主要任務(wù)。
        (三)結(jié)構(gòu)與性能關(guān)系的研究與應(yīng)用按照已知的結(jié)構(gòu)和性能的關(guān)系設(shè)計(jì)制造需要的新材料是進(jìn)行大量結(jié)構(gòu)測(cè)定的目的。如何總結(jié)大量已測(cè)結(jié)構(gòu)的規(guī)律并與其性能、功能相聯(lián)系是今后的任務(wù)之一。特別是生物結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系。進(jìn)一步如何利用這種關(guān)系設(shè)計(jì)制造人類(lèi)需要的材料,藥物等, 更是永不完結(jié)的任務(wù)。
       。ㄋ模┙馍锎蠓肿咏Y(jié)構(gòu)方法的發(fā)展目前雖已有各種方法用來(lái)解決相角的問(wèn)題,但要置換許多同晶化合物還是頗費(fèi)時(shí)和頗昂貴的,如果能如小分子那樣用直接法來(lái)解決相角問(wèn)題,將會(huì)方便許多。我國(guó)科學(xué)家范海福院士是研究直接法的世界權(quán)威人物,正在進(jìn)行這方面的研究。
       。ㄎ澹 單晶體結(jié)構(gòu)分析實(shí)驗(yàn)方法的發(fā)展目前的實(shí)驗(yàn)室單晶體結(jié)構(gòu)分析方法對(duì)于測(cè)定小分子的單晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)是相當(dāng)完美了, 但對(duì)于巨大的生物大分子就顯得軟弱無(wú)力,主要是光源強(qiáng)度不夠,光的平行性不良,波長(zhǎng)又不好調(diào)。目前主要要依靠同步輻射作為X射線(xiàn)源。我國(guó)二個(gè)同步輻射光源之一的位于合肥的國(guó)家同步輻射實(shí)驗(yàn)室(NSRL)今年上半年已勝利完成用于生物大分子結(jié)構(gòu)測(cè)定的光束線(xiàn)與實(shí)驗(yàn)站的建設(shè), 并已收集到尖吻蝮蛇蛇毒磷脂酸A2,神經(jīng)毒等多種生物大分子的衍射數(shù)據(jù),并解出了結(jié)構(gòu)。另一個(gè)北京同步輻射裝置(BSRF) 的生物平臺(tái)使用的是聚焦光束。也已于2002年12月4日投入試運(yùn)轉(zhuǎn),在樣品冷凍條件下成功地收集了18套結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),情況良好。數(shù)據(jù)分析正在進(jìn)行中。
        同步輻射是一種大科學(xué)裝置,設(shè)備大投資高,一般都需要政府投資,不是一般實(shí)驗(yàn)室所能具備的,需要申請(qǐng)立項(xiàng)才能使用。因此,如果能發(fā)展出高強(qiáng)度的實(shí)驗(yàn)室光源和極高靈敏度的探測(cè)器,使在一般實(shí)驗(yàn)室中也能測(cè)定生物大分子結(jié)構(gòu),則絕對(duì)是有益的。
        有許多生物反應(yīng)的速度是相當(dāng)快的, 如血紅蛋白與一氧化碳的結(jié)合,速度在納秒級(jí)(10-9sec),要對(duì)這種反應(yīng)進(jìn)行動(dòng)力學(xué)研究,既要有高強(qiáng)度脈沖光源, 又要有快速切換的探測(cè)器以連續(xù)跟蹤反應(yīng),F(xiàn)在已有了強(qiáng)脈沖光源,但探測(cè)器的切換速度卻慢太多,需要作長(zhǎng)時(shí)間的更大的努力。

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